Modelli di calcolo naturale (2012/2013)

Corso a esaurimento (attivi gli anni successivi al primo)

Codice insegnamento
4S000528
Docente
Vincenzo Manca
Coordinatore
Vincenzo Manca
crediti
6
Altri corsi di studio in cui è offerto
Settore disciplinare
INF/01 - INFORMATICA
Lingua di erogazione
Italiano
Periodo
I semestre dal 1-ott-2012 al 31-gen-2013.

Orario lezioni

I semestre
Giorno Ora Tipo Luogo Note
martedì 8.30 - 10.30 lezione Aula G  
giovedì 8.30 - 10.30 lezione Aula G  

Obiettivi formativi

Il corso intende presentare una analisi algoritmica e computazionale di fenomeni biologici, con particolare enfasi sulla rappresentazione genomica dell'informazione e alla analisi di dinamiche biologiche basilari.

Programma

Protocellula e strutture informazionali. Paradosso di Eigen e paradosso enzimatico. Richiami su grammatiche, automi, pattern, e linguaggi formali e teoria dell'informazione (entropia, codici e compressione). Multinsiemi e reazioni chimiche. Polimeri e sequenze, multinsiemi e membrane. Struttura matematica del DNA e doppia elica. Operazioni sulle doppie stringhe DNA e su DNA test-tube e protocolli fondamentali. DNA computing. Protocolli PCR e XPCR. Analisi genomica basata su dizionari. Indici genomici e rappresentazione di genomi Sistemi metabolici e rappresentazione discreta di sistemi biochimici. Sistemi a membrana e sistemi MP. Definizioni fondamentali. Flussi metabolici, e mappe di reazione. Esempi di modelli MP. Sistemi MP e approssimazione di funzioni reali. Dinamica inversa. Metodo dei minimi quadrati e regressione statistica. Algoritmo LGSS (Log Gain Stoichiometric Stepwise regression). Software MetaPLab ed esempi di esperimenti metabolici computazionali. Meccanismi regolativi di base in fenomeni biologici. Metabolismo e replicazione. Ubiquita’ metabolica. Applicazioni biomediche dei sistemi MP.

Modalità d'esame

Esame orale con possibile progetto concordato con il docente.

Statistiche per i requisiti di trasparenza (Attuazione Art. 2 del D.M. 31/10/2007, n. 544)

I dati relativi all'AA 2012/2013 non sono ancora disponibili