Gene design and DNA arrays laboratory (2005/2006)

Course partially running

Course code
4S00202
Credits
3
Coordinator
Tiziana Pandolfini
Teaching is organised as follows:
Unit Credits Academic sector Period Academic staff
Gene design 1 BIO/04-PLANT PHYSIOLOGY 2° sem Tiziana Pandolfini
Laboratorio di DNA arrays 2 BIO/04-PLANT PHYSIOLOGY 2° sem Tiziana Pandolfini

Learning outcomes

Modulo: Gene design
Conoscenza dei moderni metodi di analisi del trascrittoma e degli approcci sperimentali allo studio della funzione genica. Conoscenza delle tecniche di costruzione e ibridazione di DNA-microarrays.


Modulo: Laboratorio di DNA arrays
Acquisire la capacità di effettuare esperimenti di ibridazione su DNA-microarrays

Syllabus

Modulo: Gene design
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Disegno di costrutti per lo studio funzionale dei geni. Metodi di analisi del trascrittoma DNA microarrays :disegno degli esperimenti, costruzione di microarrays, microarrays ad oligonucleotidi e microarrays a cDNA. "Stampa" dei microarrays. Tecniche di estrazione di RNA totale e mRNA, amplificazione di RNA. Sintesi del cDNA e tecniche di marcatura. Ibridazione dei microarrays e acquisizione dei dati. Applicazioni dei microarrays.


Modulo: Laboratorio di DNA arrays
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Estrazione e purificazione di RNA totale e mRNA da matrici diverse. Amplificazione di RNA e sintesi di cDNA. Mmarcatura diretta ed indiretta del cDNA. Ibridazione di DNA microarrays e acquisizione dei dati.

Assessment methods and criteria

Modulo: Gene design
orale

Modulo: Laboratorio di DNA arrays
scritto

Studying