Pubblicazioni

Autori:

Calgaro, Matteo; Romualdi, Chiara; Risso, Davide; Vitulo, Nicola

Titolo:

benchdamic: benchmarking of differential abundance methods for microbiome data

Anno:

2023

Tipologia prodotto:

Articolo in Rivista

Tipologia ANVUR:

Articolo su rivista

Lingua:

Inglese

Referee:

No

Nome rivista:

BIOINFORMATICS

ISSN Rivista:

1367-4803

Intervallo pagine:

1-3

Parole chiave:

differential abundance, bioconductor, metagenomics, metabarcoding, biostatistics

Breve descrizione dei contenuti:

A Summary: Recently, an increasing number of methodological approaches have been proposed to tackle the complexity of metagenomics and microbiome data. In this scenario, reproducibility and replicability have become two critical issues, and the development of computational frameworks for the comparative evaluations of such methods is of utmost importance. Here, we present benchdamic, a Bioconductor package to benchmark methods for the identification of differentially abundant taxa.

Id prodotto:

131494

Handle IRIS:

11562/1081999

ultima modifica:

30 gennaio 2025

Citazione bibliografica:

Calgaro, Matteo; Romualdi, Chiara; Risso, Davide; Vitulo, Nicola, benchdamic: benchmarking of differential abundance methods for microbiome data «BIOINFORMATICS» , 2023 , pp. 1-3

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