Principali aree di ricerca. Sviluppo di metodi basati su tecnologie genomiche avanzate per la caratterizzazione strutturale del genoma, l'analisi delle varianti a singolo nucleotide e strutturali, l'analisi del trascrittoma e la genotipizzazione su larga scala. Genomica strutturale: assemblaggio di genomi e analisi delle variazioni strutturali. Genomica clinica: analisi di varianti a singolo nucleotide e varianti strutturali in patologie ereditarie. Genomica funzionale: analisi dell'espressione genica (inclusi miRNA) in condizioni fisiologiche e patologiche. Genomica di popolazione: genotipizzazione di popolazioni vegetali.
Insegnamenti attivi nel periodo selezionato: 29.
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Di seguito sono elencati gli eventi e gli insegnamenti di Terza Missione collegati al docente:
Argomento | Descrizione | Area di ricerca |
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Genomica clinica | identificazione e annotazione di varianti a singolo nucleotide e varianti strutturali in patologie congenite, mediante l’analisi del genoma, dell’esoma o di pannelli di genici specifici. |
Bioinformatica e Biologia Computazionale
Genomics, comparative genomics, functional genomics |
Genomica Funzionale | analisi delle varianti geniche (strutturali o a singolo nucleotide) e il loro impatto sull’espressione genica (trascrittoma) e sulla deposizione di modificazioni epigenetiche (epigenoma), sia in pianta che uomo. |
Bioinformatica e Biologia Computazionale
Genomics, comparative genomics, functional genomics |
Genomica strutturale | Assemblaggio di genomi e analisi delle variazioni strutturali attraverso tecnologie genomiche avanzate, quali il sequenziamento di seconda e terza generazione (linked-read sequencing, Single Molecule Real Time Sequencing, nanopore sequencing) e le mappe ottiche. |
Bioinformatica e Biologia Computazionale
Genomics, comparative genomics, functional genomics |
Metagenomica e metabarcoding | analisi del microbioma dell’acqua e identificazione di nuove specie mediante analisi di barcode genomici e l’utilizzo di un laboratorio di genomica portatile. |
Bioinformatica e Biologia Computazionale
Genomics, comparative genomics, functional genomics |
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