Genomi - STRUTTURA E FUNZIONE DEI GENOMI (2014/2015)

Corso disattivato

Codice insegnamento
4S00291
Crediti
6
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    Settore disciplinare
    BIO/18 - GENETICA
    Lingua di erogazione
    Italiano
    Sede
    VERONA
    L'insegnamento è organizzato come segue:
    Attività Crediti Periodo Docenti Orario
    Teoria 1 5 I sem. Massimo Delledonne
    Teoria 2 1 I sem. Massimo Delledonne

    Orario lezioni

    I sem.
    Attività Giorno Ora Tipo Luogo Note
    Teoria 1 martedì 10.30 - 12.30 lezione Aula A  
    Teoria 1 giovedì 10.30 - 12.30 lezione Aula H  
    Teoria 1 venerdì 10.30 - 12.30 lezione Aula H  

    Obiettivi formativi

    OBIETTIVI
    Il corso di Struttura e funzione dei genomi ha l'obiettivo di far acquisire allo studente conoscenze relative alla struttura dei genomi eucariotici e procariotici, e alle metodologie di analisi globale per lo studio di genomi e trascrittomi. Fornisce inoltre le informazioni relative alla replicazione ed evoluzione dei genomi, con particolare enfasi sui mecchanismi che ne regolano l’attività.


    CONTENUTI
    I progetti genoma: organizzazione e obiettivi del progetto genoma umano, genomi animali, vegetali e dei microrganismi. Mappatura, sequenziamento e assemblaggio dei genomi. Interpretazione delle sequenze genomiche e analisi globale dell’espressione genica. Anatomia dei genomi eucariotici, procariotici e virali. Funzionamento dei genomi e regolazione delle loro attività. Replicazione ed evoluzione dei genomi. Filogenetica molecolare

    TESTI CONSIGLIATI:
    GENOMI 3 T.A. Brown - EdiSes

    Programma

    Corso di Struttura e Funzione dei Genomi (LM7) mutuato con il corso di Genomica e Trascrittomica (LM9)
    AA 2013-2014


    Per la preparazione dell’esame, lo studente farà riferimento alle diapositive del corso, che contengono tutte le informazioni richieste per il brillante superamento dell’esame di Struttura e Funzione dei Genomi (LM7) e Genomica e Trascrittomica (LM9). Le diapositive sono disponibili al seguente indirizzo:
    http://profs.sci.univr.it/delledonne/Insegnamenti/Index.html
    Nella stessa pagina sono rese disponibili anche le dispense del corso di genomi e gli articoli scientifici, da considerarsi materiale integrativo per l’approfondimento degli argomenti trattati a lezione. Il campo della genomica evolve troppo rapidamente per essere affrontato con il sussidio di libri di testo

    Programma del corso
    1- Mappatura dei genomi
    Mappe genetiche e fisiche
    Marcatori molecolari
    Gene tagging
    Tail PCR
    AIMS

    2 - Metodologie di analisi del trascrittoma
    cDNA
    Northern blot
    RT-PCR
    Real Time RT PCR
    Librerie cDNA
    RACE (rapid amplification of cDNA ends)
    Librerie sottrattive
    Reverse Northern
    Differential display / CDNA-AFLP
    SAGE (Serial Analysis of Gene Expression)
    EST e electronic northern
    Microarray
    RNA-Seq

    3 - Epigenetica e regolazione dell’espressione genica
    Metilazione del DNA
    Modificazione degli istoni
    Metodologie di analisi della metilazione del DNA

    4 - Metodologie di analisi del genoma
    Metodi di sequenziamento del DNA
    Assemblaggio dei genomi
    Localizzazione dei geni in una sequenza genomica
    Determinazione della funzione dei singoli geni (in silico ed in vivo)
    Forward and Reverse genetics
    Genome wide association studies
    Diagnostica molecolare (personal genomics)

    5 - Struttura, funzione ed evoluzione dei genomi vegetali e animali
    Il genoma di Arabidopsis e il progetto 1001 genomi
    Il genoma umano (IHGC, Celera e Roche/454) e il progetto 1000 genomi
    Venter e il progetto “minimal genome”
    Il progetto ENCODE
    L'interpretazione del genoma umano (Ingenuity, Knome etc.)


    Libro di testo consigliato: Genomi 3 EdiSES ISBN 978 88 7959 431 8
    Materiale supplementare disponibile sul sito internet del docente: http://profs.sci.univr.it/delledonne/Insegnamenti/Index.html

    Modalità d'esame

    Esame scritto con domande aperte