Genomica e trascrittomica (2011/2012)

Corso disattivato

Codice insegnamento
4S02850
Crediti
6
Coordinatore
Massimo Delledonne
Altri corsi di studio in cui è offerto
Altri corsi di studio in cui è offerto
    Settore disciplinare
    BIO/18 - GENETICA
    Lingua di erogazione
    Italiano
    L'insegnamento è organizzato come segue:
    Attività Crediti Periodo Docenti Orario
    Parte 1 4 I semestre Massimo Delledonne
    Parte 2 2 I semestre Massimo Delledonne

    Orario lezioni

    I semestre
    Attività Giorno Ora Tipo Luogo Note
    Parte 1 lunedì 14.30 - 16.30 lezione Aula H  
    Parte 1 martedì 11.30 - 13.30 lezione Aula H  
    Parte 1 giovedì 14.30 - 16.30 lezione Aula H  

    Obiettivi formativi

    Il corso di Genomica e Trascrittomica ha l'obiettivo di far acquisire allo studente conoscenze relative alla struttura e alla funzione dei genomi eucariotici, e alle metodologie di analisi globale per lo studio di genomi e trascrittomi.

    Programma

    1- Mappatura dei genomi (dispense)
    Mappe genetiche e fisiche
    Marcatori molecolari
    Gene tagging
    Tail PCR
    AIMS

    2 - Metodologie di analisi del trascrittoma (dispense)
    cDNA
    Northern blot
    RT-PCR
    Real Time RT PCR
    Librerie cDNA
    RACE (rapid amplification of cDNA ends)
    Librerie sottrattive
    Reverse Northern
    Differential display / CDNA-AFLP
    SAGE (Serial Analysis of Gene Expression)
    EST e electronic northern
    Microarray
    RNA-Seq

    3 - Epigenetica (articoli) e regolazione dell’espressione genica (siRNA)?
    Metilazione del DNA
    Modificazione degli istoni
    Metodologie di analisi della metilazione del DNA

    4 - Metodologie di analisi del genoma (articoli)
    Metodi di sequenziamento del DNA
    Assemblaggio dei genomi
    Localizzazione dei geni in una sequenza genomica
    Determinazione della funzione dei singoli geni (in silico ed in vivo)
    Forward and Reverse genetics
    Genome wide association studies
    Diagnostica molecolare (personal genomics)

    5 - Struttura, funzione ed evoluzione dei genomi vegetali e animali (articoli)
    Il genoma di Arabidopsis e il progetto 1001 genomi
    Il genoma umano (IHGC, Celera e Roche/454) e il progetto 1000 genomi
    Il genoma di topo
    Il genoma del panda (primo genoma sequenziato con short reads)
    Venter e il progetto “minimal genome”




    Libro di testo consigliato: Genomi 3 EdiSES ISBN 978 88 7959 431 8

    Materiale supplementare disponibile sul sito internet del docente: http://profs.sci.univr.it/~delledon/Insegnamenti/Index.html

    Modalità d'esame

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