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organizzazione dell'insegnamento
Il laboratorio mira a fornire agli studenti gli strumenti e i metodi necessari per accedere all'informazione biologica in modo razionale ed efficiente, utilizzando le risorse disponibili in rete e programmi d'ultima generazione.
Utilizzo dei database in ambito biologico, loro struttura e metodologie di interrogazione.
Metodiche di allineamento di sequenze.
L’evoluzione e la filogenesi. Ricerca in banche dati per similarità. Significatività dell’allineamento. Riconoscimento di omologia. I programmi FASTA, BLAST e PSI-BLAST.
Predizione della struttura tridimensionale di una proteina: Modelling comparativo. Fold recognition e Ab initio. Utilizzo dei principali programmi.
Laboratorio di Genomica:
Predizione automatica di geni utilizzando i programmi di utlima generazione.
Utilizzo della banca dati ENSEMBL.
Analisi dell’espressione genica: Data mining di dati di espressione:
. estrazione ed analisi di dati da database biologici.
. Data mining di letteratura scientifica.
Annotazione funzionale:
. Gene Ontology (GO).
. geni ortologhi: loro funzione nell’annotazione funzionale.
Microarray: Utilizzo dei principali programmi e banche dati .
scritto
esercizio modeling
(pdf, it, 65 KB, 09/01/09)
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