Attività | Crediti | Periodo | Docenti | Orario |
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Teoria | 3 | I semestre | Vincenzo Manca | |
Laboratorio | 3 | I semestre | Vincenzo Manca |
Il corso presenta modelli di calcolo di ispirazione biologica (DNA e Membrane Computing), sviluppando l'aspetto di interazione tra tali modelli e l'analisi computazionale di sistemi biologici.E' fortemente consigliata le frequenza per almeno un 60% delle ore del corso.
Richiami su calcoli, grammatiche, linguaggi e automi. Calcoli bioispirati, tipi e paradigmi fondamentali. Struttura DNA, e calcoli di trascrizione e traduzione. Notazioni e Operazioni DNA. Modello geometrico di forme molecolari bilineari. Operazioni su DNA test tube. Modello di Adleman-Lipton e analisi algoritmica di protocolli DNA. PCR. XPCR. Membrane e calcoli su membrane. MP sistemi. Algoritmi metabolici e modelli biologici basati su grammatiche MP. Modelli di dinamiche biologiche. Problemi di biologia computazionale sintetica.
Esame orale con possibile discussione su un progetto preventivamente definito.
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