Scienze omiche - MODULO II (2016/2017)



Codice insegnamento
4S003719
Crediti
6
Settore disciplinare
CHIM/01 - CHIMICA ANALITICA
Lingua di erogazione
Italiano
L'insegnamento è organizzato come segue:
Attività Crediti Periodo Docenti Orario
Metabolomica laboratorio 2 II sem. Flavia Guzzo
Proteomica laboratorio 1 II sem. Alessandra Maria Bossi
Proteomica teoria 3 II sem. Alessandra Maria Bossi

Orario lezioni

Obiettivi formativi

Fornire allo studente i concetti teorici e principi pratici di base per lo studio del proteoma.

Programma

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MM: Metabolomica laboratorio
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-il disegno sperimentale; -l’estrazione dei metaboliti e la preparazione dei campioni per la metabolomica basata su LC-MS; -formati e conversione dei dati in metabolomica; -l’analisi dei cromatogrammi e l’annotazione dei metaboliti; -il pre-processamento dei dati e l’effetto di varie tecniche di normalizzazione; -il processamento dei dati (tramite MZmine); estrazione delle “M/z” features; la deconvoluzione dei cromatogrammi e l’allineamento dei dati; produzione della “Feature Quantification Matrix”; -analisi dei dati attraverso tecniche multivariate (PCA, PLS-DA, OPLS-DA) ed univariate.
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MM: Proteomica laboratorio
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1. Introduzione. 2. La preparazione del campione. 3. Metodiche Gel-Based. 4. Metodiche Gel-Free. 5. Il pre-frazionamento per l’analisi di proteine poco abbondanti. 6. Analisi di proteine/peptidi tramite spettrometria di massa e massa/massa. 7. Analisi degli spettri di massa e ricerca in Banche Dati per l’identificazione delle proteine. 8. Proteomica quantitativa. 9. Applicazioni in ambito agro-alimentare dell’analisi proteomica.
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MM: Proteomica teoria
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1. Introduzione. 2. La preparazione del campione. 3. Metodiche Gel-Based. 4. Metodiche Gel-Free. 5. Il pre-frazionamento per l’analisi di proteine poco abbondanti. 6. Analisi di proteine/peptidi tramite spettrometria di massa e massa/massa. 7. Analisi degli spettri di massa e ricerca in Banche Dati per l’identificazione delle proteine. 8. Proteomica quantitativa. 9. Applicazioni in ambito agro-alimentare dell’analisi proteomica.

Modalità d'esame

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MM: Metabolomica laboratorio
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Esame orale.
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MM: Proteomica laboratorio
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Scritto 2 ore.
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MM: Proteomica teoria
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Scritto 2 ore

Testi di riferimento
Attività Autore Titolo Casa editrice Anno ISBN Note
Proteomica teoria Ciborowski P. and Silberring J. Proteomic profiling and analytical chemistry: the crossroads. Elsevier 2013 978-0-444-59378-8

Opinione studenti frequentanti - 2016/2017