Bioimmagini ed elaborazione dati biomedici - ELABORAZIONE DATI BIOMEDICI (2011/2012)

Corso disattivato

Spazio Moodle non più disponibile

Codice insegnamento
4S000529
Crediti
6
Altri corsi di studio in cui è offerto
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    Settore disciplinare
    INF/01 - INFORMATICA
    Lingua di erogazione
    Italiano
    Sede
    VERONA
    L'insegnamento è organizzato come segue:
    Attività Crediti Periodo Docenti Orario
    Teoria 5 I semestre Andrea Giachetti
    Laboratorio 1 I semestre Andrea Giachetti

    Orario lezioni

    Obiettivi formativi

    Acquisire conoscenze di base sull'imaging diagnostico digitale, la gestione dell'imaging ospedaliero e studiare i principali algoritmi utilizzati per la visualizzazione e l'analisi di tali immagini. Il corso comprenderà anche 1 credito di laboratorio in cui si realizzeranno implementazioni degli algoritmi in Matlab (ITK)

    Programma

    1. Imaging diagnostico

    Obiettivo: Ripasso sulle immagini digitali e acquisizione di competenze sull'imaging ospedaliero.
    -Modalità diagnostiche digitali: CT, MRI, US, PET, ecc.
    -Il protocollo DICOM: archiviazione e trasmissione dei dati medici

    2- Visualizzazione 3D in medicina
    Obiettivo: fornire una panoramica sulle tecniche di visualizzazione dei dati utilizzate in ambito radiologico ospedaliero
    -Tecniche di visualizzazione di volumi, proiezioni, ray casting
    -Applicazioni informatiche in medicina: Computer Aided Diagnosis, pianificazione chirurgica, simulazione

    3. Segmentazione di immagini mediche
    Obiettivo: Acquisire la conoscenza delle tecniche di segmentazione, ricostruzione e visualizzazione di strutture da immagini 3(4)D principalmente utilizzate nella pratica.
    - Sogliature, region growing, morfologia matematica
    - Tecniche basate su classificazione (k-means, Mean shift), Graph Cuts, MRFs
    - "Snakes" e modelli deformabili 2D e 3D, impliciti ed espliciti


    4. Registrazione di immagini.

    Obiettivo: Acquisire la conoscenza delle tecniche di registrazione di immagini 2D-3D
    -Registrazione di immagini, problematiche e metodi
    -Registrazione image based: potenziali, tecniche di ottimizzazione
    -Registrazione point based, algoritmo ICP

    5. Analisi del moto da sequenze di immagini

    Obiettivo: Acquisire la conoscenza delle tecniche di ricostruzione del movimento da sequenze di immagini.
    - Campo di moto e flusso ottico
    - Algoritmi per la sitma: block matching, Lucas-Kanade

    6. Analisi di forma
    Obiettivo: caratterizzare le strutture in 2D e 3D per eventuale classificazione automatica o misura
    - Momenti, descrittori di forma, distance functions, estrazione di scheletri curvilinei

    7. Analisi di tessitura.
    Obiettivo: Introdurre il concetto di tessitura e gli algoritmi che si utilizzano
    principalmente per la sua analisi e classificazione
    -Tessitura delle immagini
    -Descrittori di tessitura: Gray Level Co-Occurrence Matrices e Run Length Matrices, Wavelets
    -Richiami sulla classificazione supervisionata

    Modalità d'esame

    Prova scritta con domande a risposta aperta sul programma svolto a lezione (20/30). Valutazione di un progetto di laboratorio (10/30)

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