Struttura e funzione dei genomi (2011/2012)

Codice insegnamento
4S000870
Crediti
6
Settore disciplinare
BIO/18 - GENETICA
Lingua di erogazione
Italiano
L'insegnamento è organizzato come segue:
Attività Crediti Periodo Docenti Orario
Parte 1 4 I semestre Massimo Delledonne
Parte 2 2 I semestre Massimo Delledonne

Orario lezioni

I semestre
Attività Giorno Ora Tipo Luogo Note
Parte 1 lunedì 14.30 - 16.30 lezione Aula H  
Parte 1 martedì 11.30 - 13.30 lezione Aula H  
Parte 1 giovedì 14.30 - 16.30 lezione Aula H  

Obiettivi formativi

Il corso di Genomica e Trascrittomica ha l'obiettivo di far acquisire allo studente conoscenze relative alla struttura e alla funzione dei genomi eucariotici, e alle metodologie di analisi globale per lo studio di genomi e trascrittomi.

Programma

1- Mappatura dei genomi (dispense)
Mappe genetiche e fisiche
Marcatori molecolari
Gene tagging
Tail PCR
AIMS

2 - Metodologie di analisi del trascrittoma (dispense)
cDNA
Northern blot
RT-PCR
Real Time RT PCR
Librerie cDNA
RACE (rapid amplification of cDNA ends)
Librerie sottrattive
Reverse Northern
Differential display / CDNA-AFLP
SAGE (Serial Analysis of Gene Expression)
EST e electronic northern
Microarray
RNA-Seq

3 - Epigenetica (articoli) e regolazione dell’espressione genica (siRNA)?
Metilazione del DNA
Modificazione degli istoni
Metodologie di analisi della metilazione del DNA

4 - Metodologie di analisi del genoma (articoli)
Metodi di sequenziamento del DNA
Assemblaggio dei genomi
Localizzazione dei geni in una sequenza genomica
Determinazione della funzione dei singoli geni (in silico ed in vivo)
Forward and Reverse genetics
Genome wide association studies
Diagnostica molecolare (personal genomics)

5 - Struttura, funzione ed evoluzione dei genomi vegetali e animali (articoli)
Il genoma di Arabidopsis e il progetto 1001 genomi
Il genoma umano (IHGC, Celera e Roche/454) e il progetto 1000 genomi
Il genoma di topo
Il genoma del panda (primo genoma sequenziato con short reads)
Venter e il progetto “minimal genome”




Libro di testo consigliato: Genomi 3 EdiSES ISBN 978 88 7959 431 8

Materiale supplementare disponibile sul sito internet del docente: http://profs.sci.univr.it/~delledon/Insegnamenti/Index.html

Modalità d'esame

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