Struttura e funzione dei genomi integrato con bioinformatica avanzata (2009/2010)

Codice insegnamento
4S02766
Crediti
12
Coordinatore
Massimo Delledonne
Altri corsi di studio in cui è offerto
L'insegnamento è organizzato come segue:
Modulo Crediti Settore disciplinare Periodo Docenti
BIOINFORMATICA AVANZATA (I) 6 BIO/10-BIOCHIMICA Vedi pagina del modulo Vedi pagina del modulo
STRUTTURA E FUNZIONE DEI GENOMI(I) 6 BIO/18-GENETICA II semestre Massimo Delledonne

Obiettivi formativi

Modulo: STRUTTURA E FUNZIONE DEI GENOMI(I)
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Il corso di Struttura e funzione dei genomi ha l'obiettivo di far acquisire allo studente conoscenze relative alla struttura dei genomi eucaristici, e alle metodologie di analisi globale per lo studio di genomi e trascrittomi.


Modulo: BIOINFORMATICA AVANZATA (I)
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Programma

Modulo: STRUTTURA E FUNZIONE DEI GENOMI(I)
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Metodologie di analisi del genoma:

Marcatori molecolari
Mappe fisiche e genetiche
Metodi di sequenziamento del DNA
Gene tagging

Metodologie di analisi del trascrittoma:

Reverse Northern
Librerie cDNA
RACE (rapid amplification of cDNA ends)
Librerie sottrattive
Differential display / CDNA-AFLP
SAGE (Serial Analysis of Gene Expression)
EST e electronic northern
Microarray
RNA-Seq

Struttura, funzione ed evoluzione dei genomi vegetali e animali:

Il genoma di Arabidopsis e il progetto 1001 genomi
Il genoma umano (IHGC, Celera e Roche/454) e il progetto 1000 genomi
Il genoma di topo
Il genoma di cane
Il genoma di gatto
Il genoma di riso
Il genoma di vite
Il genoma di mais
Il genoma del panda (primo genoma sequenziato con short reads)


Modulo: BIOINFORMATICA AVANZATA (I)
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Modalità d'esame

Modulo: STRUTTURA E FUNZIONE DEI GENOMI(I)
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Esame scritto


Modulo: BIOINFORMATICA AVANZATA (I)
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