Caratterizzazione strutturale mediante NMR, mutagenesi sito-diretta e proprietà di legame di proteine strutturalmente omologhe appartenenti alla famiglia delle lipocaline allo scopo di identificare un possibile comune meccanismo di folding e la relazione struttura-funzione

Data inizio
5 novembre 2002
Durata (mesi) 
24
Dipartimenti
Biotecnologie
Responsabili (o referenti locali)
Molinari Henriette
Parole chiave
Biologia molecolare e strutturale, Mutagenesi sito-diretta, Risonanza magnetica nucleare, Lipocaline, Folding, Interazioni

Il compito di questa unità all'interno del progetto sarà quello di condurre uno studio strutturale ed una analisi dei meccanismi di folding e di legame per proteine strutturalmente correlate, appartenenti alla famiglia delle lipocaline.
Lo studio verterà inizialmente sul paragone tra beta-lattoglobuline di diverse specie, in particolare bovina e porcina. Tali proteine, pur mostrando una identità di sequenza maggiore del 60% ed una similarità maggiore dell'80%, mostrano comportamenti assai differenti relativamente all'interazione ed al folding. Il confronto delle loro caratteristiche chimico-fisiche, accompagnato dall'analisi di opportuni mutanti ed esteso ad altre proteine della stessa famiglia, ci permetterà di indagare i determinanti principali della stabilità, dei meccanismi di dimerizzazione e di folding, mentre le proprietà di legame con acidi grassi a diversa lunghezza di catena e loro derivati, permetterà di correlare le caratteristiche dell'interazione a proprietà funzionali.

L'attività sarà focalizzata sui seguenti obiettivi:
  1. caratterizzazione strutturale della beta-lattoglobulina porcina (PLG) ricombinante arricchita in 15N e doppiamente arrichita (13C e 15N). Caratterizzazione di tutti i mutanti prodotti.
  2. studi comparati di folding di beta lattoglobulina bovina (BLG) e PLG e caratterizzazione della struttura dello stato denaturato.Tale studio sarà esteso ai mutanti prodotti;
  3. analisi conformazionale di frammenti di BLG e PLG;
  4. studi di interazione tra BLG, PLG ed acidi grassi a diversa lunghezza di catena;
  5. studi di modelling e analisi termodinamica di BLG, PLG e relativi mutanti.

Enti finanziatori:

Ministero dell'Istruzione dell'Università e della Ricerca
Finanziamento: assegnato e gestito da un ente esterno all'ateneo
Programma: FIRB

Partecipanti al progetto

Federico Fogolari
Henriette Molinari
Raffaella Ugolini

Attività

Strutture