Scienze omiche - MODULO I (2017/2018)



Codice insegnamento
4S003719
Crediti
6
Settore disciplinare
AGR/07 - GENETICA AGRARIA
Lingua di erogazione
Italiano
L'insegnamento è organizzato come segue:
Attività Crediti Periodo Docenti Orario
Metabolomica teoria 2 II sem. Flavia Guzzo

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Trascrittomica laboratorio 3 II sem. Diana Bellin

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Trascrittomica teoria 1 II sem. Diana Bellin

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Obiettivi formativi

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MM: Metabolomica teoria
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L’obiettivo principale del corso del corso è quello di introdurre l’analisi metabolomica, come mezzo per studiare la complessità biologica di cellule/tessuti/organi/organismi, dal punto di vista delle piccole molecole, quali intermedi e prodotti finali del metabolismo. L’approccio metabolomico verrà descritto come catena sequenziale di stadi consecutivi ed interconnessi, dal disegno sperimentale fino all’analisi e al “modeling” dei dati.
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MM: Trascrittomica laboratorio
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MM: Trascrittomica teoria
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Programma

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MM: Metabolomica teoria
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-il disegno sperimentale; -l’estrazione dei metaboliti e la preparazione dei campioni per la metabolomica basata su LC-MS; -formati e conversione dei dati in metabolomica; -l’analisi dei cromatogrammi e l’annotazione dei metaboliti; -il pre-processamento dei dati e l’effetto di varie tecniche di normalizzazione; -il processamento dei dati (tramite MZmine); estrazione delle “M/Z” features; la deconvoluzione dei cromatogrammi e l’allineamento dei dati; produzione della “Feature Quantification Matrix”; -analisi dei dati attraverso tecniche multivariate (PCA, PLS-DA, OPLS-DA) ed univariate.
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MM: Trascrittomica laboratorio
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MM: Trascrittomica teoria
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Modalità d'esame

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MM: Metabolomica teoria
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L’accertamento dei risultati di apprendimento prevede una prova orale, durante la quale verrà accertato: -il grado di conoscenza in genere della materia sviluppata nel corso di studio; - la proprietà di linguaggio relativa alla materia in oggetto.
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MM: Trascrittomica laboratorio
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MM: Trascrittomica teoria
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Opinione studenti frequentanti - 2017/2018