| Attività | Crediti | Periodo | Docenti | Orario |
|---|---|---|---|---|
| teoria | 5 | II semestre | Daniela Cecconi | |
| esercitazioni | 1 | II semestre | Daniela Cecconi |
La Proteomica è lo studio su larga scala delle proteine. È un campo della ricerca scientifica emergente che può essere applicato ad esempio al settore alimentare (per identificare allergeni per esempio) e alla ricerca in ambito vegetale (ad esempio per studiare la risposta pianta/patogeno) e alla ricerca biomedica (proteomica clinica).
In particolare la proteomica clinica è la scienza che si prefigge di sviluppare tecnologie per la cura dei pazienti attraverso l’analisi e lo studio dei proteomi delle diverse cellule, sane e malate. Questa area di ricerca si prefigge di individuare proteine che possano essere utilizzate come marcatori precoci nel sangue, nell’urina, o nei tessuti di pazienti affetti ad es. da tumori, o che possano predire la risposta alla terapia o la probabilità della ricaduta dopo un trattamento.
Modulo: PROTEOMICA
Proteomica analitica (LM9+LM7):
1. Introduzione.
2. La preparazione del campione.
3. Metodiche Gel-Based.
4. Analisi delle immagini di mappe 2D.
5. Metodiche Gel-Free.
6. Il pre-frazionamento per l’analisi di proteine poco abbondanti.
7. Analisi di proteine/peptidi tramite spettrometria di massa.
8. Analisi di proteine/peptidi tramite spettrometria di massa/massa.
9. Analisi degli spettri di massa e ricerca in Banche Dati per l’identificazione delle proteine.
10. La proteomica quantitativa e differenziale.
11. Caratterizzazione delle modificazioni post-traduzionali delle proteine.
12. Applicazioni in ambito agro-alimentare e in ambito biomedico dell’analisi proteomica.
Proteomica clinica (LM9):
13. Applicazioni della proteomica nella ricerca sul cancro.
14. Il linfoma a cellule del mantello: trattamento con resveratrolo, e analisi fosfoproteomica.
15. Il tumore al pancreas: profiling fosfoproteomico di cellule trattate con agonisti di CB1 e CB2; e analisi shotgun di cellule staminali.
16. Dalle malattie del metabolismo ferro all’ipertensione: l'applicazione della proteomica clinica.
17. Macrofagi e metabolismo del ferro, Linfoma splenico SMZL.
18. Ritardo di crescita intrauterino e Malattie Cardiovascolari.
19. Malattie autoimmuni.
20. Infezioni batteriche e virali.
Laboratori didattici (1 CFU)
1 giorno:
Reidratazione IPG 7 cm con estratto proteico
Preparazione tamponi e soluzioni per analisi 2-DE
Polimerizzazione gel 12% T
Isoelettrofocalizzazione con PROTEAN® IEF Cell (Bio-Rad)
2 giorno:
Equilibrazione strip IPG
Interfacciamento con la II dimensione
Corsa della seconda dimensione con Mini-PROTEAN® 3 Dodeca™ Cell (Bio-Rad)
Colorazione overnight mappe 2-DE con Coomassie e SyproRuby
3 giorno:
Decolorazione e acquisizione delle immagini con VersaDoc™ MP 1000 system (Bio-Rad)
Analisi delle immagini con software PDQuest (Bio-Rad) (aula gamma)
Analisi spettri di massa e ricerca in database con Mascot
La frequenza ai laboratori è obbligatoria.
LM7: scritto
LM9: scritto + esposizione paper
Testo consigliato:
“Introducing Proteomics: From concepts to sample separation, mass spectrometry and data analysis” Josip Lovric, Wiley-Blackwell
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