Basi di dati biomediche e bioinformatiche (2012/2013)

Corso a esaurimento (attivi gli anni successivi al primo)



Codice insegnamento
4S000527
Crediti
6
Coordinatore
Barbara Oliboni
Settore disciplinare
INF/01 - INFORMATICA
Lingua di erogazione
Italiano
L'insegnamento è organizzato come segue:
Attività Crediti Periodo Docenti
Teoria 5 II semestre Barbara Oliboni
Esercitazioni 1 II semestre Barbara Oliboni

Orario lezioni

II semestre
Attività Giorno Ora Tipo Luogo Note
Teoria lunedì 9.30 - 11.30 lezione Aula H  
Teoria mercoledì 10.30 - 13.30 lezione Aula H  

Obiettivi formativi

L'insegnamento si propone di richiamare le nozioni fondamentali della progettazione di basi di dati e successivamente di considerare il contesto della progettazione delle basi di dati biomediche.
Inoltre l'insegnamento si propone di approfondire la gestione e interrogazione di banche dati bioinformatiche, con particolare attenzione alla gestione di dati semistrutturati e alle opportune tecniche di recupero dell'informazione.

Programma

- Richiamo ai concetti di progettazione di basi di dati
-- Progettazione concettuale
-- Progettazione logica

- Il linguaggio XML

- Basi di dati biomediche
-- Modellazione e gestione di dati clinici
-- Cartelle cliniche elettroniche
-- Sistemi di gestione di cartelle cliniche
--- Standardizzazione terminologica e sistemi di codifica

- Basi di dati bioinformatiche
-- Gestione di dati semistrutturati
-- Tecniche di recupero dell'informazione
-- XML e BIO

Modalità d'esame

La verifica del profitto avviene mediante una prova scritta, nella quale vengono proposte sia domande sulle parti più teoriche sia brevi esercizi sugli aspetti più applicativi.

Testi di riferimento
Attività Autore Titolo Casa editrice Anno ISBN Note
Teoria P. ATZENI, S. CERI, S. PARABOSCHI, R. TORLONE Basi di dati- Modelli e linguaggi di interrogazione (Edizione 3) McGraw-Hill 2009 9788838666001 Capitoli 1, 2, 7, 8 e 9
Teoria R. Maceratini, F. L. Ricci Il medico on-line. Manuale di Informatica Medica. Verduci Editore 2000 88-7620-575-6 Capitoli 1, 5 e 6
Teoria Robert R. Korfhage Information Storage and Retrieval Publisher John Wiley & Sons, Inc.   Capitoli 1, 3 (escluse sezioni 3.4, 3.5 e 3.7), 4 (escluse sezioni da 4.7 a 4.12) e 5 (escluse sezioni 5.5, 5.6, 5.7 e 5.10)
Teoria A. Moller, M. Schwartzbach Introduzione a XML Pearson - Addison Wesley 2007 9788871923734 Capitoli 2 e 4

Statistiche per i requisiti di trasparenza (Attuazione Art. 2 del D.M. 31/10/2007, n. 544)

I dati relativi all'AA 2012/2013 non sono ancora disponibili