Metodi analitici molecolari - GENOMICA E TRASCRITTOMICA (2009/2010)

Codice insegnamento
4S02774
Crediti
3
Altri corsi di studio in cui è offerto
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    Settore disciplinare
    CHIM/01 - CHIMICA ANALITICA
    Lingua di erogazione
    Italiano
    L'insegnamento è organizzato come segue:
    Attività Crediti Periodo Docenti Orario
    Teoria 1 I semestre Diana Bellin
    Laboratorio 2 I semestre Diana Bellin

    Orario lezioni

    I semestre
    Attività Giorno Ora Tipo Luogo Note
    Teoria martedì 9.30 - 11.30 lezione Aula H dal 6-ott-2009  al 31-gen-2010
    Laboratorio venerdì 14.30 - 17.30 lezione Laboratorio didattico Laboratorio di Biotecnologie genetiche dal 6-ott-2009  al 31-gen-2010

    Obiettivi formativi

    Il corso vuole presentare alcune delle metodologie analitiche avanzate oggi utilizzate per l’analisi del genoma, la caratterizzazione della funzione dei geni e l’analisi del trascrittoma. Il corso ha lo scopo di fornire sia una conoscenza teorica di tali tecnologie che una competenza pratica.

    Programma

    TEORIA:
    GENOMICA:
    -TECNOLOGIA GATEWAY: il sistema di ricombinazione del fago lambda ed introduzione alla tecnologia gateway, reazioni BP ed LR, sistema di selezione basato su gene ccdB, come ottenere un ENTRY clone, TOPO cloning, vettori di destinazione gateway compatibili.
    -MUTAGENESI: mutazioni, utilizzo della mutagenesi in genetica diretta ed inversa, mutagenesi random (chimica e basata su PCR), mutagenesi sito diretta (basata su PCR o no), Quickchange, DNA shuffling.
    TRASCRITTOMICA:
    -RT-PCR E REAL TIME RT-PCR: metodiche per l’analisi dell’espressione genica di singoli geni e su vasta scala, RT-PCR, Real Time RT-PCR, quantificazione assoluta e relativa (esempio di analisi dei dati: metodo delta delta Ct), SYBR green per real time RT-PCR, sonde TaqMan, LUX, Molecolar Beacons e Scorpions
    -MICROARRAY: cDNA microarray e loro produzione, oligoarray e loro produzione, marcatura diretta ed indiretta dei campioni, disegno sperimentale e controlli per analisi microarray, ibridazione, acquisizione dell’immagine e cenni generali su analisi dei dati

    LABORATORIO:
    Clonaggio di un gene mediante la tecnologia Gateway e trasferimento del gene in un vettore di destinazione
    Analisi di espressione mediante Real Time RT-PCR
    Analisi trascrittomica mediante microarray

    Modalità d'esame

    Vedi pagina del corso integrato