Proteomica strutturale, funzionale e di espressione

Michael Assfalg
Professore associato
Alessandra Astegno
Ricercatore
Matteo Ballottari
Professore associato
Stefano Capaldi
Ricercatore
Daniela Cecconi
Professore associato
Mariapina D'Onofrio
Ricercatore
Massimiliano Perduca
Ricercatore
Competenze
Argomento Persone Descrizione ISI-CRUI
Biochemistry & Molecular Biology - Biochemistry & Molecular Biology aderente allo standard  ISI
Biophysical Chemistry Daniele Dell'Orco
Biochimica Fisica e dei Sistemi, nanobiofisica, basi molecolari di malattie retiniche, interazioni fra proteine e nanodispositivi, rapporto struttura-funzione in complessi proteici, sensori neuronali del calcio, bioinformatica e biologia computazionale. Biochemistry & Biophysics
Clinical molecular biology Martina Montagnana
Gian Luca Salvagno
Indagini di biologia molecolare applicate al contesto clinico. Molecular Biology & Genetics
Enzymology and Protein chemistry Mariarita Bertoldi
studio della chimica delle proteine e dei meccanismi di funzionamento degli enzimi
Genome editing Donato Zipeto
Sviluppo di protocolli di genome editing mediante CRISPR/Cas9 e di linee cellulari knock-out; analisi del ruolo della β2-microglobulina nell’eziologia di malattie neurodegenerative;
Inquinamento da metalli Giuseppe Carra
Inquinamento da metalli
Interazioni virus-cellula Donato Zipeto
Studio del ruolo del sistema MHC-I nel controllo dell’infezione da HIV
Meccanismi molecolari dell'attività antitumorale di vari composti Marta Palmieri
Strategie innovative per inibire la proliferazione cellulare dell'adenocarcinoma pancreatico in modelli cellulari e animali.
Meccanismi molecolari di chemioresistenza in cellule di cancro del pancreas Massimo Donadelli
Strategie innovative per inibire la proliferazione cellulare dell'adenocarcinoma pancreatico in modelli cellulari e animali. Meccanismi molecolari oncogenici indotti da p53 mutata. Regolazione trascrizionale mediante modificazioni epigenetiche; regolazione dello stress ossidativo e dei meccanismi molecolari dell'autofagia nel cancro.
Meccanismi protettivi di fitocomposti in sistemi cellulari modello di patologie Marta Vittoria Menegazzi
Meccanismi protettivi di fitocomposti in sistemi cellulari modello di patologie
Medicina di laboratorio - biochimica clinica - analisi ematochimiche - medicina traslazionale - biomarcatori Giuseppe Lippi
Medicina di laboratorio - biochimica clinica - analisi ematochimiche - medicina traslazionale - biomarcatori
Protein chemistry and Enzymology Alessandra Astegno
Matteo Ballottari
Comprensione delle relazioni struttura, dinamica e funzione di proteine, e dei meccanismi di funzionamento degli enzimi
Stress ossidativo e infiammazione Sofia Giovanna Mariotto
-Cross-talk funzionale tra le diverse isoforme di NO sintasi: modulazione della produzione di NO in modelli di infiammazione in vitro -Meccanismo molecolare dell’attività apoptotica di composti naturali in modelli tumorali in vitro. -Stress ossidativo e modifiche post-traduzionali dei fattori trascrizionali STATs.
Structural Molecular Biology Stefano Capaldi
Ugo Luigi Monaco
Massimiliano Perduca
Studi di correlazione struttura-funzione di proteine mediante la diffrazione di raggi X, la Surface Plasmon Resonance (SPR) e tecniche calorimetriche (ITC-DSC), incentrandosi su proteine che hanno la proprietà di legare piccole molecole idrofobiche.
Struttura e funzione di aggregati proteici Giovanni Gotte
Studi strutturali e funzionali di multimeri e oligomeri proteici, in paricolare di varie ribonucleasi di tipo pancreatico, ottenibili tramite modifiche chimiche e/o cross linking, o attraverso aggregazione proteica tramite scambio tridimensionale di domini.
Trasduzione del segnale - biosintesi di proteine secrete Elio Maria Liboi
Glicosilazione e vie di segnalazione dei recettori ad attività tirosino chinasi nel pathway secretorio.
Validazione di metodi di chimica clinica. Elisa Danese
Sviluppo e validazione di test biochimici e molecolari
Chemistry - Analytical aderente allo standard  ISI
Chimica Analitica - Proteomica Daniela Cecconi
Questa area di ricerca prevede l’utilizzo delle tecniche della Proteomica per lo studio su grande scala delle proteine (in particolare delle loro regolazioni nel livello di espressione). L’analisi proteomica, la nuova frontiera della ricerca biologica e medica, è fondata essenzialmente sulle metodologie proprie della “chimica analitica”. Lo studio del proteoma, infatti, si basa sulla separazione e sulla successiva analisi qualitativa (identificazione) e quantitativa di popolazioni di analiti di natura proteica, ponendo al centro la metodologia di più rilevante impatto sulla moderna chimica analitica: la spettrometria di massa. In particolare nel laboratorio di Proteomica si effettuano purificazioni e prefrazionamento di estratti proteici (da campioni di origine umana, animale, vegetale e microbiologica), cromatografie, elettroforesi 2D, analisi delle immagini delle mappe 2D, western blot 2D, identificazioni di proteine tramite spettrometria di massa. Chemistry & Analysis
Chemistry - Multidisciplinary aderente allo standard  ISI
Chimica delle biomacromolecole Michael Assfalg
Mariapina D'Onofrio
Caratterizzazione strutturale di biomolecole, riconoscimento biomolecolare, interazioni proteina-ligando e nanoparticella-biomolecola. Applicazioni di spettroscopia NMR biomolecolare.
Laboartorio NMR Henriette Molinari
Chemistry
Laboratorio NMR Henriette Molinari
Chemistry
Gruppi di ricerca
Nome Descrizione URL
Biochimica Responsabile: prof.ssa Paola Dominici – Referente sicurezza: Alessandra Astegno
Biocristallografia
Laboratorio di Biosfruttamento dell'Energia Solare (SOLE-LAB) https://www.solelab.org/ https://www.solelab.org/
Laboratorio di Fotosintesi Biochimica e fisiologia molecolare della fotosintesi
Proteomica e spettrometria di massa Responsabile: prof.ssa Daniela Cecconi – Referente sicurezza: Daniela Cecconi
Spettroscopia NMR Indagini strutturali e dinamiche di biomolecole mediante spettroscopia di risonanza magnetica nucleare in alta risoluzione
Progetti
Titolo Responsabili Fonte finanziamento Data inizio Durata (mesi) 
“Abuse of Smart Drugs: impacts on society, healthcare, law; damages in young athletes: epidemiology; pathology, biochemistry and toxicology.” Federica Bortolotti MIUR - FIRB 01/04/13 48
A combined biochemical and cell biology approach to improve the pharmacological treatment of PH1: from pyridoxine derivatives to proteostasis regulators Barbara Cellini 01/10/12 30
AGGREGAZIONE DI RIBONUCLEASI DI TIPO PANCREATICO: DALL'RNAsi A ALL'ANGIOGENINA. IMPLICAZIONI NELL'INSORGENZA DELLA SCLEROSI LATERALE AMIOTROFICA (SLA). Giovanni Gotte PRIN VALUTATO POSITIVAMENTE 01/12/08 24
Analisi proteomica del cancro colorettale Piergiorgio Righetti, Daniela Cecconi, Alberto Milli Ateneo 31/01/06 36
Analisi proteomica del linfoma a cellule del mantello Daniela Cecconi, Marco Chilosi, Alberto Zamo' Ateneo 31/01/06 36
Analisi proteomica di tumori pancreatici esocrini ed endocrini Daniela Cecconi, Marta Palmieri, Aldo Scarpa Ateneo 31/01/07 36
Analisi proteomica per studiare gli effetti dell’acido miristico sul metabolismo lipidico e sulla miristilazione proteica di cellule HepG2 Daniela Cecconi 01/01/15 36
Analysis of the interaction between HLA-C and HIV-1 Env Donato Zipeto Unione Europea 01/01/10 24
Anti-STAT3 and -NF-kB phytocompounds against glioma Hisanori Suzuki PRIN VALUTATO POSITIVAMENTE 25/05/10 24
Azione concertata italiana per lo sviluppo di un vaccino contro HIV-AIDS (ICAV) Donato Zipeto ISS Istituto Superiore di Sanità 11/09/06 18
Biochemical study of the modulation of JAK/STAT pathway by sesquiterpenes from Artemisia Sofia Giovanna Mariotto PRIN VALUTATO POSITIVAMENTE 25/05/10 24
Biologia strutturale e funzionale di proteine coinvolte nel trasporto di ligandi e nella regolazione dell'attività cellulare Ugo Luigi Monaco PRIN VALUTATO POSITIVAMENTE 24/03/06 24
Biosintesi della D-serina: caratteristiche molecolari e proprietà funzionali della serina racemasi da mammifero Mariarita Bertoldi PRIN VALUTATO POSITIVAMENTE 01/01/08 24
Caratterizzazione strutturale della proteina 14-3-3 gamma umana Ugo Luigi Monaco PRIN VALUTATO POSITIVAMENTE 07/01/05 36
Caratterizzazione strutturale e funzionale della prostaglandina D sintetasi umana (beta trace). Ugo Luigi Monaco Fondazione Cariverona 01/05/09 24
Determinazione strutturale del mutante della Transtiretina (TTR F64L) Massimiliano Perduca Ateneo 10/01/05 36
Emoglobine vegetali esacoordinate: ruolo dei residui distali della tasca di legame dell'eme Paola Dominici Ateneo 01/10/05 12
Engineering a fusion enzyme for determination of bioactive amines Alessandra Astegno 01/01/16 24
Enzimi PLP-dipendenti come target di molecole ad azione antimicrobica e chemioterapica Alessandra Astegno 01/01/15 48
Epigenetic effects of chronic alcohol consumption on colonic mucosa Simonetta Friso 09/03/06 36
European Vaccines and Microbicides Enterprise (EUROPRISE) Donato Zipeto Unione Europea 01/01/07 60
Finding new markers for Intrauterine Growth Restriction Daniela Cecconi Ateneo 01/01/10 36
FP7/2007-2013 - Utility of omic-based biomarkers in characterizing older individuals at risk for frailty, its progression to disability and general consequences to health and well-being - The FRAILOMIC Initiative Giuseppe Lippi 01/01/13 60
Identificazione e caratterizzazione di proteine e peptidi bioattivi poco abbondanti del siero di latte Daniela Cecconi Ateneo, Elda s.r.l. 01/10/09 24
Il riconoscimento molecolare nelle interazioni proteina-ligando, proteina-proteina e proteina superficie: sviluppo di approcci sperimentali e computazionali integrati per lo studio di sistemi di interesse farmaceutico Ugo Luigi Monaco Ministero dell'Istruzione dell'Università e della Ricerca, MIUR - FIRB 12/09/05 48
Indagini sul meccanismo di formazione degli oligomeri della ribonucleasi A e sulle loro attività biologiche Massimo Libonati Ministero dell'Istruzione dell'Università e della Ricerca 01/01/04 24
Induzione di anticorpi neutralizzanti ad ampio spettro contro il virus dell'immunodeficienza umana (HIV) per lo sviluppo di un vaccino contro l'AIDS. Donato Zipeto Fondazione Cariverona 17/01/06 24
INFIAMMAZIONE ED AUTOIMMUNITA' CYTOMEGALOVIRUS-MEDIATA IN CORSO DI ARTERIOSCLEROSI CORONARICA: UN APPROCCIO INTEGRATO, CLINICO E PROTEO-GENOMICO, PER IL DESIGN DI NUOVE STRATEGIE DIAGNOSTICHE E TERAPEUTICHE. Oliviero Olivieri PRIN VALUTATO POSITIVAMENTE 01/06/06 24
Lipid transfer proteins e membrane biologiche: studi sulle interazioni dirette e mediate da lipidi o proteine di membrana Massimo Crimi Ateneo 01/07/04 12
Molecular mechanism of anti-inflammatory action of plant compounds: in vitro and in vivo study Hisanori Suzuki PRIN VALUTATO POSITIVAMENTE 01/01/07 24
Natural and modified flavonoids and terpens in phyto-chemio-prevention and treatment. Hisanori Suzuki PRIN VALUTATO POSITIVAMENTE 09/02/09 24
Next generation technologies for the investigation of B-cell lymphoma Daniela Cecconi FIRB VALUTATO POSITIVAMENTE 01/01/10 36
Nuove applicazioni della spettrometria di massa ad alta risoluzione alla medicina e scienze forensi Franco Tagliaro Ministero dell'Istruzione dell'Università e della Ricerca 22/09/08 24
Nuove tecnologie e metodologie tossicologico-forensi applicate allo studio dell’associazione tra incidenti stradali e tipologie di uso/abuso alcolico con riguardo particolare alla popolazione giovanile veronese Franco Tagliaro Fondazione Cariverona 01/05/09 24
Nuovi approcci per la cura della fibrosi cistica mediante terapia genica e cellulare Donato Zipeto Regione Veneto 09/04/10 24
Profilo metabolomico del liquido amniotico nel diabete gestazionale, ritardo di crescita intrauterino (IUGR), malattie del rene e delle vie urinarie e dell'apparato respiratorio Marco Zaffanello 26/02/15 36
Purificazione, cristallizzazione e studi di diffrazione di raggi X di una lectina con attività antitumorale da rizomi di Arundo donax: ADL (Arundo Donax Lectin) Massimiliano Perduca Ministero dell'Istruzione dell'Università e della Ricerca 04/12/08 24
Purificazione, studi strutturali e di interazione con ligandi di due nuove lectine con attività antitumorale: ADL (Arundo Donax Lectin) e POL (Pleurotus Ostreatus Lectin) Massimiliano Perduca Ministero dell'Istruzione dell'Università e della Ricerca 19/03/10 24
Regolazione genetica ed epigenetica dell'espressione di geni della coagulazione: effetti funzionali sulla via del FVII-TF e conseguenze sul rischio di malattia arteriosa coronarica Oliviero Olivieri MIUR - PRIN 30/09/04 24
Ricerca di marcatori molecolari proteici nel tumore pancreatico tramite analisi proteomiche di cellule staminali tumorali Daniela Cecconi, Marta Palmieri 01/01/14 60
Ruolo delle Lipid Transfer Protein come proteine di difesa: attività antimicrobica e ruolo dell scambio lipidico Massimo Crimi Ateneo 01/09/05 12
RUOLO DI PARP-1 NELLA REGOLAZIONE DELLE VIE DI TRASDUZIONE DEL SEGNALE ATTIVATE NELL'ASMA ALLERGICO. Marta Vittoria Menegazzi PRIN VALUTATO POSITIVAMENTE 01/01/06 24
RUOLO DI PARP-1 NELLA REGOLAZIONE DELLE VIE DI TRASDUZIONE DEL SEGNALE ATTIVATE NELL'ASMA ALLERGICO. (2004) Marta Vittoria Menegazzi Ministero dell'Istruzione dell'Università e della Ricerca 01/01/04 24
RUOLO DI PARP-1 NELLE VIE DI TRASDUZIONE DEL SEGNALE ATTIVATE IN PROCESSI INFIAMMATORI ASSOCIATI ALL'ASMA. (2007) Marta Vittoria Menegazzi Ministero dell'Istruzione dell'Università e della Ricerca 01/01/07 24
Structural and functional biology of proteins involved in ligand transport and cellular activity regulation Ugo Luigi Monaco PRIN VALUTATO POSITIVAMENTE 18/09/07 24
Studi di diffrazione di raggi X su lectine con importanti proprietà farmaceutiche isolate da funghi commestibili. (continuazione, anno 2004) Ugo Luigi Monaco Ateneo 07/01/04 36
Studio e definizione dei range di normalità delle concentrazioni di CDT nel siero umano. Franco Tagliaro 31/10/06 2
Studi strutturali e funzionali sulle calmoduline e calmodulin-like proteins di Arabidopsis Alessandra Astegno 01/01/15 48
Studi strutturali e funzionali sulle emoglobine di Arabidopsis Paola Dominici Ateneo 01/09/04 12
Studi strutturali su due isoforme della proteina muscleblind-like 1 umana Ugo Luigi Monaco PRIN VALUTATO POSITIVAMENTE 04/12/08 24
Studi strutturali su proteine che legano molecole idrofobiche Ugo Luigi Monaco PRIN VALUTATO POSITIVAMENTE 30/11/04 24
Un approccio integrato allo studio di struttura e funzione della lipocalina 15 umana e del ruolo da essa svolto, in condizioni normali e patologiche. Ugo Luigi Monaco PRIN VALUTATO POSITIVAMENTE 19/03/10 24
Vaccine development and selection Donato Zipeto ISS Istituto Superiore di Sanità 24/11/04 15

Attività

Strutture